关键线索通常分为三类：物证、证言和环境细节。物证包括现场遗留的物品、文件或痕迹，例如照片、监控录像、化验报告等，这些往往是破解案件的核心依据。证言则来自案件相关人员，包括嫌疑人、目击者或受害者的陈述，但需注意其中可能存矛盾或隐瞒。环境细节则涉及场景布置、时间线或人物行为异常，比如破损的摄像头、异常的物品摆放等。主线案件通常要求玩家综合这三类线索，通过逻辑推理还原真相。
主线案件的线索收集方式多样，玩家需要通过现场调查、对话审讯和庭审举证三个阶段逐步推进。现场调查阶段，玩家可自由调整视角，点击场景中的可疑物品获取线索，部分关键线索可能隐藏在不易察觉的位置，如相框背面、抽屉夹层或监控死角。对话审讯阶段，玩家需分析角色证词，结合已有物证找出矛盾点，部分角色在特定情绪下会透露隐藏信息。庭审阶段则需按逻辑顺序出示证据，最终揭露真相。
主线案件中的部分线索具有关联性，需通过线索分析功能组合验证。亲子鉴定报告需与高铁乘车记录结合，才能证明嫌疑人的行踪矛盾；白色粉末化验报告需与交易记录对照，才能锁定毒品来源。游戏内设案情推演系统，玩家可将碎片化线索拖入推理板，系统会自动提示逻辑链是否完整。若推理错误，玩家需重新检查遗漏线索或调整证据组合方式。
主线案件的难度随章节递增，后期案件会出现多线程线索和干扰项。例如第四章的袁霆案需同时观察药物痕迹、奇装异服和手上的茧等细节，而第五章的记忆谜题需回溯时间线比对不同角色的叙述差异。建议玩家在复杂案件中优先整理时间线和人物关系图，系统内的档案功能可随时回顾已收集的线索。
完成主线案件后，玩家可通过神秘人对话解锁隐藏剧情，部分线索会直接影响支线任务或角色好感度。主线案件与个人支线存在交叉，例如左然的支线任务会补充主线中未提及的律所内部资料。专项活动如旧梦新生或雪落有声可能复刻主线线索，帮助玩家补全剧情拼图。
主线案件的线索设计注重现实性与游戏性的平衡，既保留了法律推理的严谨框架，又通过高自由度搜证和动态卡面增强沉浸感。玩家需保持耐心与细致，避免因遗漏细节导致推理偏差。游戏内左上角的放大镜功能可辅助扫描场景，但过度依赖可能降低解谜乐趣。
